Synopsis:

Krypton est un monde jadis à la pointe de la colonisation spatiale, mais qui aujourd'hui s'est condamné, en imposant le contrôle des naissances, c'est-à-dire en interdisant toute naissance naturelle, et en décidant à l'avance quel serait le rôle de chacun dans la société, grâce au Codex, objet en forme de crâne contenant tous les gènes des kryptoniens à venir, et déterminant leur fonction sociale, comme dans une fourmilière. D'autre part, les kryptoniens se sont détournés de l'espace, et ont décidé d'exploiter les ressources naturelles de leur planète et de forer le noyau de Krypton, abîmant dangereusement ce dernier. Le scientifique Jor-El prévient le Conseil de Krypton de ce danger, et lui demande en vain de lui remettre le Codex afin qu'il assure la continuité de la race kryptonienne. En effet, lui et sa femme Lara ont défié la loi eugénique de leur monde en concevant un enfant, nommé Kal-El, et en le faisant naître naturellement (mais Jor-El se garde bien de révéler ceci au Conseil). C'est alors qu'un coup d'état mené par le général Dru-Zod, renverse le Conseil. Zod, ami de Jor-El, lui propose de se joindre à lui afin d'assurer que « les lignées les plus importantes survivent ». Jor-El refuse, argumentant que le choix de ces lignées n'incomberait qu'à Zod, et que ce dernier a trahi son peuple en dirigeant le putsch. Jor-El est alors arrêté, mais il s'évade et réussit à mettre la main sur le Codex, avant de regagner sa demeure. Là, il prépare le lancement de la fusée de son fils, qui l’emmènera sur une planète dont le soleil est plus jeune : la Terre. Lara est cependant réticente à laisser partir son fils, argumentant qu'il mourra peut-être dans l'espace, et qu'ils n'auront jamais le bonheur de le voir grandir ; mais elle accepte, car au moins, il pourra vivre sur une planète où aux yeux des terriens, « il sera un dieu », et, en pleurs, elle place Kal-El dans sa fusée, tandis que son père dissout le Codex dans les cellules du jeune kryptonien. C'est alors que le général Zod, prévenu du vol du Codex, arrive chez Jor-El. Il réclame que ce dernier lui remette le Codex, mais s'emporte lorsqu'il lui annonce qu'il a eu un fils né naturellement. Un combat s'engage alors entre les deux anciens amis, dans lequel Jor-El a le dessus. En désespoir de cause, Zod supplie Lara d'annuler le vol, argumentant que le Codex est l'avenir de Krypton ; Lara semble hésiter, puis lance le vol. De rage et de désespoir, Zod sort une lame cachée, et en transperce Jor-El, qui tombe mort. Puis, Zod rejoint ses troupes, et tente de faire abattre le vaisseau de Kal-El, mais à ce moment, les troupes fidèles au gouvernement surviennent et le font prisonnier. Pour leurs crimes, Zod et son état-major sont condamnés à être emprisonnés dans la Zone Fantôme, prison où le temps s'écoule différemment, et où plusieurs années peuvent sembler comme quelques jours. Fou de rage, Zod insulte le Conseil, avant d'assurer à Lara, présente au jugement, qu'il retrouvera son fils. Puis, la sentence est appliquée. Un peu plus tard, la planète Krypton explose, et Lara prie Kal de construire un monde meilleur que celui de ses ancêtres.